不但平安京内的日军被屠戮一空，就连日本普通民众，死在常胜军手上的，也不下五万。
从午夜杀到午时，到了中午一两点钟的时候，城内刚刚有些平静。李明峰此刻，率领常胜军各级将领，齐齐入城，接管日本皇宫。
李明峰进城之后，发现李秀成已经将明治天皇俘虏。老李通过审讯得知，原来明治天皇果然发觉了炽仁亲王的谋反意图。
因为强敌在侧，明治天皇不敢在城外和炽仁亲王开战，所以就假意将其迎入京都。当天夜里，明治天皇派亲信大将，带数百武士，偷袭炽仁亲王府。炽仁亲王府中，有明治天皇内应，所以只片刻，猝不及防的炽仁亲王就被斩杀。
本来明治天皇以为，斩杀了贼首，叛乱就被平定了。这样他又能集中精力对付常胜军了。但是明治天皇毕竟年轻，对局势判断过于简单。
炽仁亲王虽然伏诛，但是以炽仁亲王为首的一党却还健在。这帮人得知炽仁亲王伏诛，而又不见明治天皇的赦免诏书，生怕下个遇害的就是自己，于是召集徒众，发起叛乱，进攻皇宫。
叛军虽然并无首脑，而且数量不算多，但是毕竟祸起萧墙，仍然让城内日军措手不及。明治天皇听说叛军开始攻打皇宫，惊骇万分，连忙调集城上守军协防皇宫。这样，就给了常胜军机会，让老李轻易的攻进了平安京。
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李明峰此刻，正端坐在日本天皇的“龙椅”之上，看着跪在地上的年仅十八岁的明治天皇。
“天皇陛下，你放心，我是不会杀你的！”李明峰笑眯眯的说道。
听了翻译，明治天皇面上却并无波澜，看来，他并不以此为喜。
正当老李准备进一步审问的时候，就看旁边的蔡宜群快步上前，在老李耳边低语道：“大清方面有变！慈禧太后调集三十万大军，并分两路，一路十万，由荣禄统领，往保定方向进攻；一路二十万，由奕统领，往辽东方面进逼！”
李明峰闻言，面色大变。
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李明峰得知后方起火，连忙将日本的事情安抚了下来。
老李仍然保留了明治天皇的虚号，但是只将他当作傀儡。老李留两千常胜军士兵负责守护日本皇宫，将明治天皇的起居完全限制在皇宫之中。
李明峰任命松平容保为新一代的征夷大将军，让他自己带兵去征讨各方，统一日本。松平容保虽然得了个征夷大将军的头衔，但是他手中兵力有限，无力统一日本，其权势也仅仅限于日本西半部。江户城和江户以北的半个日本的事务，松平容保还无力干涉。
李明峰率军乘船经朝鲜，返回辽东。此刻，奕正率大军围困金州城。李明峰从朝鲜借兵五万，再加上常胜军本军五万，总共十万大军，和金州城内守军里应外合，苦战三月，将看似强大的奕军击溃，史称“金州会战”。
金州会战结束后，常胜军乘胜追击，又经过“辽阳大捷”、“山海关大捷”，将朝廷精锐全部歼灭。
1869年农历新年，李明峰在龚半伦、李秀成、蔡宜群等等常胜军老将的鼓动下，在盛京宣布登基称帝，国号“中华帝国”。李明峰发布诏书，号召“驱逐满人，恢复中华”。